关于用ChatGPT写代码这件事

新项目启动已经过去了一周，我总算是重新找回了写插件的感觉。暂时还达不到分享试用的程度，就随便跟大家聊点什么吧。

首先要说的是，为什么这个项目叫做“MolScaffold”？

其实在最初编写Mol3DStruct的时候，我就在考虑插件名称的问题。想来想去都觉得不合适，最后还是借用的2018年在3dsMax中写的分子插件的名称。

从2018到2024，这七年间我用过多款专业的分子可视化软件，包括Diamond、PyMol和Chimera等。对于分子结构的可视化也算是颇有心得。直到我接触到Blender软件之后，逐渐摸索出一套基于点线骨架+几何节点的可视化方法。

所以在开始这个2.0项目的时候，我毫不犹豫地选择了MolScaffold这个名字。

第二个想说的是如何写代码的问题。

我不是计算机专业，本科的时候只修过一门C语言的课。记得那会儿还是我人生中第一次接触电脑，只得了个B+的成绩。

真正编一点程序是在我研究生毕业前后那几年，主要用的是Fortran和Matlab。基本上属于自娱自乐，和专业人士比起来相差甚远。再之后，就是自学了一点Python基础，包括这个项目主要用到的Blender Python在内。

去年年底到今年上半年，我遇到代码上的问题基本都求助于Google。国外有专业的Blender Python相关论坛，大概能帮我解决70~80%的问题。剩下的靠自己摸索。拼拼凑凑，总算是把Mol3DStruct给整了出来。不少人说很好用，但和我预想的还是有些差距。如果打分的话，我给自己打65分。

其实，写插件这事儿，代码的问题还是其次。首先要考虑的是底层架构和用户体验，也就是说，我还得兼任产品经理的角色。

虽然Blender的几何节点很好用，但对于分子可视化这个庞大复杂的系统，节点数量是惊人的，节点网络是复杂的。我可不指望用户能搞明白其中的原理，于是我就想办法让节点看上去更加简洁有条理。

本来我是想用节点组的方式，但折腾了大半个月都没有用代码实现。最后，退而求其次，弄了下面这么个玩意儿。看上去是简洁了一些，但不多。

好在这次我尝试用ChatGPT辅助，这是我要说的第三个问题。

由于有了项目1.0的经验，在插件架构上我的思路很清晰，先生成分子骨架，然后筛选结构，选择可视化模式（包括结构和材质类型），最后一键渲染。遇到代码上的问题时，我就打开ChatGPT，比如当我问道：

如何用rdkit读取SMILES文本？

ChatGPT给我的回答是：

# 导入 RDKit 模块from rdkit import Chem
# 示例 SMILES 字符串smiles = 'CCO'  # 乙醇的 SMILES 表示



    
# 使用 RDKit 从 SMILES 读取分子mol = Chem.MolFromSmiles(smiles)
# 打印分子对象print(mol)
# 如果需要查看分子的 SMILES 表示，可以使用 MolToSmiles 函数print(Chem.MolToSmiles(mol))

虽然这些代码在rdkit的API Reference中也能找到，但直接用ChatGPT可以节省大量的搜索时间。

于是，我花了半天时间，用ChatGPT搞定了之前一直困扰我的自定义几何节点组的问题。在MolScaffold中，你看到的节点基本是下面这样，简直不要太清爽！之后我会把一些必要的参数设置做成端口显示，方便用户调节。

最后，跟大家汇报下项目进展：

本次开发我是在Blender 4.2.1 LTS版本中进行的，应该会向上兼容至4.0版本。插件位置还是在View_3D窗口的右侧边栏。

这次除了分子文件外，我还考虑了分子名称、SMILES、结构式图片智能识别等多种读取方式。此外，还可以从PubChem和RCSB PDB数据库直接通过编号导入分子。

例如，Aspirin在PubChem网站的CID编号是2244。只需要在输入栏输入“2244”，然后点击“创建骨架”按钮，就可以导入Aspirin分子的点线骨架啦。

当然，你要是能写出Aspirin分子的SMILES符号，也可以直接创建。

今天就先跟大家聊到这里吧，我得继续工作去了。