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深度学习辣汤小组文献阅读学习之一百零一篇
利用机器学习技术识别COVID-19患者ICU预后预测因素
DeepLearning 深度学习辣汤小组
2023/4/10
2021年,来自德国图宾根大学医学院的Harry Magunia等人通过机器学习技术,利用临床数据创建一个预测模型对病人风险进行分类,预测他们在ICU中的生存可能性。并在Critical Care(IF:19.3,医学 1区)期刊上发表题为“Machine learning identifies ICU outcome predictors in a multicenter COVID-19 cohort ”的文章。
DOI:
https://doi.org/10.1186/s13054-021-03749-5
一、研究背景
2020年,COVID-19大流行影响了全球,导致ICU入院人数激增。虽然已经发表了几份关于大流行期间ICU经验的报告,但报告的病例数和结果有很大的差异,而且很少有人去确定预测发病率、死亡率和整体临床结果的风险因素。为了弥补这一点,该研究采用机器学习方法,调查ML是否能够为ICU结果的预测提供可解释的见解。同时评估在预测COVID-19 ICU患者结果时所纳入临床因素的重要性。
二、数据集
这项研究是一项在德国27家医院进行的多中心研究。研究包括在2020年1月1日至2021年5月4日期间需要入住ICU的成年COVID-19患者。所有患者均通过了SARS-CoV-2 PCR检测,确认为COVID-19阳性,最终共有1186名患者入选。该研究收集了49个变量的数据,包括人口统计学数据、过去的病史、以前的药物、目前的疾病数据、实验室值等信息。模型使用80%的数据进行训练,20%的数据进行测试,并训练过程中使用进行五倍交叉验证。
三、方法
在整个模型开发过程中,使用SVC、RF和可解释促进机(EBM,explainable boosting machines model)训练机器学习模型。EBM是建立在广义加法模型之上的一种机器学习算法,能够很容易地解释变量对预测的影响,并且考虑到了变量和结果预测之间的复杂关系 。此外,还使用超参数优化对机器学习模型进行了优化,并以平均准确率和精确-召回曲线下面积(PR-AUC,the area under precision-recall curve)来评估模型性能。
四、结果与结论
表1给出了不同机器学习模型的总体性能,可以看出与其他模型相比,EBM模型能够提供准确和可解释的预测,这有助于临床医生更好地了解可能影响 COVID-19 患者在重症监护病房预后的因素。从图1还可以看出前十个最重要的预测变量是年龄、血小板/中性粒细胞比、d -二聚体等,说明年龄、炎症和血栓活动等为预测ICU生存的最重要预测因素。
本项研究确定了可以结合起来预测COVID-19患者生存情况的风险因素,并对这些因素按重要性进行了排序,这将辅助临床医生在病人接受治疗之前,对病人的治疗结果进行预测。
表1:机器学习模型在ICU预后预测中的整体表现
图1:在EBM预测模型中预测变量的重要性
Pepper soup transformed by: Geng Shi
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