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Python for Bioinformatics 为生物信息学设计的Python教程

djangolover • 11 年前 • 8594 次点击  

作者翻译了 《Python for Bioinformatics》这本书,他在网上见到有一本书叫Python for Bioinfomatics, 作者是SEBASTIAN BASSI,让他爱不释手。

他说:

Python在生物信息中有很好的应用,正如我在ChinaUnix论坛的讨论中提到的:

1,Python的学习曲线很好。对于没有接触编程的人能很快上手,对有编程经验的人更是容易写。 Python代码的阅读性好,学习别人写的Python,像在读一本小说一样流畅,这一点是别的语言比不了的。

2,Python的数据结构特别适合生物信息。比如Python的序列用于生物序列的分析是得天独厚的,其字典功能的强大更不用说了。 Python的面向对象很好,能很容易把生物信息学中的数据对象化。

3,Python有诸多的软件包支持,扩展性很好。除了有广泛的计算机科学的软件支持外,生物信息学中需要的许多模块有Biopython,pygr支持,还有matplotlib,networkx,scipy等科学计算、研究中强大的软件包支持,python是一种很好的胶水语言,与R有rpy的接口,能提供很好的统计学支持。

4,Python同样支持正则表达式,使得它在文本处理方面,能力不比perl差。

因此,他翻译了 《Python for Bioinformatics》这本书,大家有兴趣可以看看他的博客 :

http://blog.sciencenet.cn/blog-565112-510336.html

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本文地址:http://www.python88.com/topic/104
 
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